De viktigste elementene i naturlige innsjøer er geografisk plassering, og størrelsen og formen på bassenget. Det er fem typer av naturlige innsjøer og de er ørretvann, to-etasjers innsjøer, walleye innsjøer, bass-panfish innsjøer, og roughfish innsjøer.
Trout innsjøer er veldig dyp og kald. De har meget lav fertilitet. De fleste ørretvann har steinete bassenger og er vanligvis fylt med stream ørret og naturlig lake ørret.
To-etasjers innsjøer er mye mer fruktbare enn ørretvann. To-etasjers innsjøene har vask av stein, grus og sand.
Dette bidrar til å dempe veksten av ugress. I dybden på to-etasjers sjøen er ørret, coolwater fish, warmwaterfish, daler, og small fisk.
Walleye innsjøer er det meste fruktbar. Walleye innsjøer bassenger er sand med grus og stein. Luke vekst i et walleye innsjøen er moderat. Walleye innsjøen inneholder varmtvann fisk, coolwater fish, daler, gjedde, bass, og panfish.
Bass-panfish innsjøer er stort sett frukt med mye ugress. Bass-panfish innsjøer inneholder bass, solabbor, gjedde, og daler.
Roughfish innsjøer er svært fruktvann, og de har litt sand eller grus.
Plantene vokser bare i den grunne delen av roughfish innsjøer. Disse innsjøene inneholde bullheads, karpe, bass, og panfish.
naturlige innsjøer variere fra å være fruktbar til infertile. I noen naturlige innsjøer blir vannet for grunt for fisk. Denne prosessen kalles aldring og det tar thosands år for at dette skal skje. Fruktvann er vanligvis omgitt av svært rikt jordsmonn. Dette legger en meget stor mengde nitrogen og andre gjødslings elementer til sjøen.