Does som gjør det til det beste valget for et isolat? Nei, men mange bedrifter fortsatt skyve den som den hellige gral av myse. Ionebytting er gjort ved å ta et konsentrat og går det gjennom det som kalles en ionebytterkolonne for å få en ionebytter-whey isolat. Høres ganske fancy, men det er alvorlige ulemper med denne metoden. Som nevnt ovenfor, er whey protein et komplekst protein består av mange underfraksjons peptider som har sine egne unike effekter på helse og immunforsvar. Noen av disse underfraksjonene finnes bare i meget små mengder.
I sannhet, de subfracti